Palabras clave
Buffer SB
optimización
basidiomiceto
protocolo no comercial
identificación molecular
Cómo citar
Resumen
La obtención de ADN de alta calidad constituye un paso esencial en estudios genéticos y moleculares. En hongos, la región ITS del ADN ribosomal se ha consolidado como un marcador de referencia para identificación taxonómica, filogenia y aplicaciones de metabarcoding. Sin embargo, la extracción de ADN en basidiomicetos como Ganoderma enfrenta dificultades derivadas de la rigidez de la pared celular y la presencia de compuestos secundarios que afectan la pureza del material genético. En este estudio se evaluó y optimizó un protocolo de extracción de ADN para Ganoderma sp., reemplazando el uso de SDS por CTAB y el ajuste en la concentración de NaCl. Se analizaron seis muestras en dos grupos de diferente cantidad de tejido (25 y 50 mg), verificando la calidad del ADN mediante electroforesis y su viabilidad a través de la amplificación de la región ITS2 por PCR. Los resultados mostraron bandas definidas y libres de contaminantes en todas las muestras, sin diferencias significativas en la calidad del ADN entre ambos grupos, siempre que se ajustara el volumen de buffer. La amplificación de ITS2 se logró en el 100% de los casos, obteniéndose fragmentos de aproximadamente 900 pb, tamaño mayor al reportado en la literatura, lo que podría deberse a variaciones intraespecíficas o al uso de cebadores diferentes. Estos hallazgos confirman la eficacia del protocolo optimizado y resaltan la necesidad de estudios adicionales para profundizar en la diversidad genética de Ganoderma sp. y su potencial biotecnológico.
Citas
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