Origen del perfil de mutaciones presente en las secuencias de SARS-CoV-2 en El Salvador

  • Carlos Alexander Ortega Pérez Departamento de Microbiología, Facultad de Medicina, Universidad de El Salvador, El Salvador
  • Noé Rigoberto Rivera Departamento de Bioquímica, Facultad de Medicina, Universidad de El Salvador, El Salvador
  • Xochitl Sandoval López Dirección, Instituto Nacional de Salud, San Salvador, El Salvador https://orcid.org/0000-0002-0988-1313
  • Carlos Enrique Hernández Ávila Departamento de Gobernanza, Instituto Nacional de Salud, San Salvador, El Salvador
Palabras clave: SARS-CoV-2, D614G, NGS, 2019-nCoV, COVID-19s

Resumen

Introducción. En el presente trabajo se describe el perfil de mutación y se analizan los distintos mecanismos responsables de las mutaciones en las primeras 6 secuencias completas del genoma de SARS-CoV-2 a partir de muestras de pacientes salvadoreños con diagnóstico de COVID-19. Objetivo. Analizar el perfil de mutaciones de acuerdo a los mecanismos que dan origen a las mutaciones presentes en SARS-CoV-2. Metodología. Se realizó un análisis de los cambios en las secuencias del genoma de SARS-CoV-2 utilizando como referencia la secuencia Wuhan (NC_045512.2), una vez conocidas las mutaciones, se procedió a tabular y generar gráficos de los SNPs y los genes afectados, además se analizó los posibles mecanismos descritos responsables de generar las mutaciones analizadas. Resultados. El análisis reveló que las mutaciones encontradas han sido reportadas a nivel mundial, sin embargo, las secuencias presentan mayor semejanza con los cambios descritos en Norte América, sumado a ello, el análisis global permitió clasificarlas en el caldo GISAID GH, y linaje pangolín B.1.2 y B.1.370, ambos linajes con una alta prevalencia en EUA, lo cual refuerza la hipótesis del origen norteamericano de las secuencias salvadoreñas. El patrón de cambios del genoma de SARS-CoV-2 en El Salvador, sugiere que las mutaciones son debidas a la acción de las desaminasas APOBEC (transición C>T) y ADARs (transición A>G), al efecto de especies reactivas de oxígeno (ROS) (transversión G>T), a errores propios del complejo replicación transcripción (RTC) que escapan a la corrección de la actividad exonucleasa de NSP14 y eventos de recombinación.

Publicado
2022-06-30
Cómo citar
Ortega Pérez, C. A., Rivera, N. R., Sandoval López, X., & Hernández Ávila, C. E. (2022). Origen del perfil de mutaciones presente en las secuencias de SARS-CoV-2 en El Salvador. Revista Científica Multidisciplinaria De La Universidad De El Salvador - Revista Minerva, 5(2), 9-22. Recuperado a partir de https://minerva.sic.ues.edu.sv/index.php/Minerva/article/view/169
Sección
Artículos Científicos

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